🧬 Обчислювальні пайплайни аналізу геномних даних

Genome AssemblyNewSimulate shotgun sequencing where reads are shredded from a genome, randomly positioned with… Genome AssemblyNewExplore de Bruijn graph assembly by chopping reads into k-mers, creating nodes for… Злиття мереж подібності: визначення підтипів пацієнтів за багатоомним профілемNewОб'єднайте мережі подібності пацієнтів за геномними, транскриптомними та протеомними даними… Детектор варіацій числа копій генів (CNV) за глибиною прочитанняNewЗмоделюйте дані глибини прочитання секвенування цілого геному вздовж хромосоми та виявляйте… Інтеграція даних багатьох -оміків у дослідничий платформуNewІнтеграція геноміки, транскриптоміки, протеоміки в єдину модель хвороби. Пайплайн виявлення варіантів за повною геномною секвенцієюNewПайплайн виявлення варіантів з сирих ридів секвенування (FASTQ→VCF). Розрахунок полігенного ризик-скору для мультифакторних хворобNewРозрахунок полігенного ризик-скору для мультифакторних хвороб. Інтерактивний Manhattan plot для дослідження асоціацій геном-хворобаNewДослідник асоціацій геном-хвороба, інтерактивний Manhattan plot. Базколінг сигналу нанопорового секвенатора в реальному часіNewБазколінг сигналу нанопорового секвенатора в реальному часі.