UK 
EnglishТипова
Polski🧬 Епігенетика
Досліджуйте метилювання ДНК, модифікацію гістонів і як екологічні фактори вмикають та вимикають гени без зміни послідовності.
Про цю симуляцію
Ця модель демонструє, як метилювання ДНК, ацетилювання гістонів і метилювання H3K4 об'єднуються, щоб задати компактизацію хроматину і, своєю чергою, рівень експресії чотирьох реальних генів людини — BRCA1, TP53, MYC і CDKN2A. Показники замовчування й активації зважуються та підсумовуються, щоб дати кожному гену ймовірність експресії від 0 до 1, тоді як імовірність успадкування оцінює шанс того, що поточний епігенетичний стан збережеться через поділ клітини.
Що показано
Чотири повзунки керують зваженою формулою замовчування-проти-активації для кожного гена. Метильовані CpG-сайти й щільна компактизація хроматину знижують експресію; ацетилювання гістонів і метилювання H3K4 підвищують її. Екологічний сигнал додає бонус чи штраф для кожного гена окремо.
Як користуватися
Перетягуйте повзунки метилювання CpG, ацетилювання гістонів, метилювання H3K4 і компактизації хроматину, потім оберіть екологічний сигнал (спека, холод, багате поживними речовинами середовище чи голодування) з випадного меню. Спостерігайте, як вигляд нуклеосом і стовпчикова діаграма експресії чотирьох генів оновлюються миттєво, разом із показниками загальної експресії, імовірності успадкування та стану хроматину.
Чи знали ви?
Приблизно 60-70% промоторів генів людини лежать у межах CpG-острівців, і метилювання цих острівців — один із найпоширеніших способів замовчування генів-супресорів пухлин, таких як TP53, при раку.
Часті запитання
Які гени відстежує симуляція?
Чотири реальні гени людини: BRCA1, TP53, MYC і CDKN2A. Кожен має власну шкалу експресії й реагує по-різному на однакові налаштування метилювання, ацетилювання й компактизації, бо екологічні сигнали дають кожному гену окремий бонус чи штраф.
Як обчислюється рівень експресії?
Фактори замовчування (метилювання зважене найвище, потім компактизація, потім низький H3K4) комбінуються й віднімаються від активуючих факторів (ацетилювання, метилювання H3K4 і будь-який екологічний бонус), а потім обмежуються між 0% і 100%, щоб дати висоту стовпця для кожного гена.
Що означає показник імовірності успадкування?
Він поєднує ацетилювання, частку неметильованих CpG-сайтів і метилювання H3K4 в один показник, що приблизно оцінює, наскільки ймовірно поточний активний чи замовчений стан буде точно скопійовано в дочірні клітини після поділу.
Що визначає, чи хроматин позначено як еухроматин, чи гетерохроматин?
Показник стану хроматину перевіряє компактизацію й ацетилювання разом з метилюванням: висока компактизація понад 70% дає гетерохроматин, високе ацетилювання з низьким метилюванням дає еухроматин, а все інше позначається як змішаний стан.
Що змінюють опції екологічного сигналу?
Тепловий стрес, холодовий стрес, багате поживними речовинами середовище й голодування — кожен застосовує фіксований позитивний чи негативний бонус до показника активації кожного з чотирьох генів перед перемальовуванням стовпців експресії, імітуючи, як реальні екологічні сигнали можуть змінювати експресію генів через епігенетичні канали.
Досліджуйте метилювання ДНК, модифікацію гістонів і як екологічні фактори вмикають та вимикають гени без зміни послідовності.
2D · HTML5 Canvas 2D · ціль 60 FPS · працює повністю на стороні клієнта, без встановлення