Головна▸Статті▸Біологія

П ротеогеноміка

Об'єднання багатоомних шарів для розуміння експресії генів та функції білків.

mysimulator teamОновлено — червень 2026≈ 3 хв читання▶ Відкрити симуляцію

Трубопроводи (Pipeline)

Створення індивідуальних баз даних білків з використанням RNA-seq

Пошук MS/MS та контроль FDR (False Discovery Rate)

Варіативні пептиди та нові з’єднання

жива демонстрація · пов'язана симуляція● LIVE

Застосування

Виявлення неоантигенів, розв’язання ізоформ та отримання інформації про шляхи метаболізму.

Приклади

Приклад: Робочий процес Протеогеноміки пухлин

Згенерувати дані RNA-seq та протеоміки.

Створити власну базу даних; здійснювати пошук і фільтрацію.

Пріоритизувати неоантигени для валідації.

Часті запитання

Розмір бази даних?

Балансуйте охоплення з ризиком хибних відкриттів.

Контроль FDR?

Використовуйте цілі-насадки з суворими пороговими значеннями.

Посттрансляційні модифікації?

Розробляйте стратегії пошуку з контрольованим розширенням.

Підготовка зразків?

Використовуйте послідовні протоколи та контроль якості.

Валідація?

Проводьте незалежні дослідження та цілеспрямований MS (масс-спектрометрію).

Обчислення?

Ефективний пошук і зберігання даних.

Анотація?

Оновлюйте моделі генів на основі доказів.

Неоантигени?

Прогнозування зв'язування HLA та імуності.

Стандарти?

Дотримання принципів FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) даних та звітування.

Етика?

Згода та захист даних.

Спробуйте наживо

Усе, що вище, працює прямо у вашому браузері — відкрийте Michaelis-Menten Kinetics і змінюйте параметри під час роботи. Нічого не встановлюється, нічого не завантажується на сервер, уся модель живе в одній вкладці.

▶ Відкрити симуляцію Michaelis-Menten Kinetics