Ця симуляція моделює хімічний синапс: потенціал дії запускає Ca²⁺-залежне злиття везикул у пресинаптичному терміналі, яке вивільняє нейромедіатор — той дифундує через синаптичну щілину (~20 нм), зв'язується з постсинаптичними рецепторами і породжує ЗБСП або ГБСП. Вивільнення не є подією "все або нічого" — чим вища ймовірність вивільнення, тим імовірніше, що на конкретний спайк вийде великий мультивезикулярний викид, а транспортери зворотного захоплення тим часом безперервно прибирають вільний нейромедіатор зі щілини.
Везикули вивільняються з пресинаптичного терміналу пачками, дрейфують за рахунок броунівського руху та дифузійного поштовху через щілину, і або зв'язуються з рецептором (той стає золотим і зсуває постсинаптичний потенціал), або повертаються назад у термінал через зворотне захоплення. Графік у реальному часі показує отриманий ПСП у мілівольтах, який згасає до нуля після кожної події.
Перемикайте тип нейромедіатора між глутаматом (збудливий) і ГАМК (гальмівний), а тоді регулюйте повзунками ймовірність вивільнення, швидкість зворотного захоплення і щільність рецепторів. Задайте автоматичну частоту стимуляції в герцах або запускайте поодинокі спайки кнопкою "Потенціал дії", а перемикачем "Блокувати рецептори" подивіться, як антагоніст повністю прибирає постсинаптичну відповідь.
Вивільнення синаптичних везикул у реальних нейронах справді ймовірнісне — навіть сильний потенціал дії не гарантує вивільнення нейромедіатора, тому симуляція на кожен спайк робить окрему випадкову перевірку ймовірності вивільнення, а не завжди видає фіксовану кількість везикул.
ЗБСП (збудливий постсинаптичний потенціал) виникає через зв'язування глутамату і зсуває симульоване значення ПСП у бік +70 мВ. ГБСП (гальмівний постсинаптичний потенціал) виникає через зв'язування ГАМК і зсуває ПСП у бік −70 мВ. Перемикнути між ними можна списком типу нейромедіатора і спостерігати, як міняється знак кривої ПСП.
Кожного разу, коли спрацьовує потенціал дії, код генерує випадкове число і порівнює його з ймовірністю вивільнення (0.1–1.0). Якщо перевірка успішна, вивільняється більший пакет із 3–7 везикул; якщо ні — лише 1–2. Збільшення повзунка робить великий, надійний викид більш імовірним результатом.
Частинку прибирають дві причини: її можуть захопити транспортери зворотного захоплення біля пресинаптичної мембрани (керується повзунком швидкості зворотного захоплення), або вона просто дрейфує задовго і видаляється. Лише частинки, що потрапляють у радіус зв'язування рецептора, коли рецептори не заблоковані, справді зв'язуються і впливають на ПСП.
Це моделює антагоніст рецепторів. Зв'язані рецептори позначаються червоним хрестиком і більше не приймають нейромедіатор, тож везикули можуть вивільнятись і дифундувати через щілину, але ПСП не генерується — спрощена модель того, як препарати на кшталт кураре чи бікукуліну блокують синаптичну передачу.
Симуляція щокадру застосовує експоненційне згасання до накопиченого ПСП, імітуючи те, як постсинаптичний мембранний потенціал повертається до потенціалу спокою після закриття іонних каналів і закінчення зв'язування рецепторів, замість того щоб залишатися постійно зміщеним після однієї події.