Як це працює
Кожна клітина-хазяїн на сітці проходить через п'ять станів. Сприйнятлива клітина стає Прикріпленою, коли вільний віріон, що рухається випадковим блуканням, стикається з нею і спрацьовує ймовірність прикріплення за контакт. Після короткої затримки зв'язування клітина переходить у фазу Затемнення — тиху фазу, під час якої вірусний геном реплікується, але нових віріонів ще не існує. Коли таймер затемнення завершується, клітина перемикається на Виробництво, активно збираючи вірусні частинки протягом фіксованої тривалості. Коли таймер виробництва завершується, клітина лізує: вона стає назавжди порожньою (Лізована) і вивільняє вибух нових вільних віріонів назовні в навколишній простір, які потім дифундують і можуть прикріпитися до сусідніх Сприйнятливих клітин, повторюючи цикл.
Вільні віріони моделюються як частинки, що виконують випадкове блукання по полотну незалежно від сітки, стикаючись із клітинами під час дрейфу. Невелика частка клітин позначається Стійкою на початку і ніколи не може бути прикріплена чи заражена, діючи як просторові протипожежні смуги, що можуть локально зупинити або повністю погасити спалах залежно від їхньої густини та розташування відносно початкових вогнищ зараження.
Attached --(затримка зв'язування)--> Eclipse (тривалість τ_E)
Eclipse --(τ_E минуло)--> Producing (тривалість τ_P)
Producing --(τ_P минуло)--> Lysed, вивільнення B віріонів
Рух віріона: x(t+1) = x(t) + N(0,σ), відбивні межі