Симуляція Біофізики

Дослідження молекулярної динаміки, згортання білків та клітинних процесів

Керування

Значення: 310 К
Значення: 7
Значення: 0.15 М

Дані в реальному часі

Температура: 0 К
pH середовища: 0
Іонна сила: 0 М
Кінетична енергія: 0 Дж
Потенціальна енергія: 0 Дж
Внутрішня енергія: 0 Дж
Ентропія: 0 Дж/К
Стан білка: Розгорнутий

Пояснення явищ

Рівняння Леннарда-Джонса

Потенціал взаємодії між атомами:

V(r) = 4ε[(σ/r)¹² - (σ/r)⁶]

де ε - глибина потенціалу, σ - відстань нульової енергії

Рівняння Больцмана

Розподіл швидкостей частинок:

f(v) = (m/2πkT)³/² e^(-mv²/2kT)

k - константа Больцмана, T - температура

Рівняння Нернста

Мембранний потенціал:

E = (RT/zF) ln([C]out/[C]in)

R - газова константа, F - константа Фарадея

Рівняння Гіббса-Гельмгольца

Зв'язок вільної енергії з ентальпією:

ΔG = ΔH - TΔS

ΔG - зміна вільної енергії, ΔH - зміна ентальпії

Часті питання

Що таке згортання білка?

Згортання білка - це процес, при якому поліпептидний ланцюг набуває своєї нативної тривимірної структури.

Як впливає температура на білки?

Підвищення температури може призвести до денатурації білка - втрати його нативної структури та функції.

Що таке pH та як він впливає на білки?

pH визначає концентрацію іонів водню та впливає на заряд амінокислотних залишків, що може змінювати структуру білка.

Як працює мембранний транспорт?

Мембранний транспорт може бути пасивним (дифузія) або активним (з витратою енергії) через спеціалізовані білки-переносники.